Etude fonctionelle de la protéine la plus abondante et de fonction inconnue chez Arthrospira Platensis
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TypeDoctorat Post-doctorat
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Mots-clésBacteries – résistance - métaux – protéines - efflux
Description
Depuis de nombreuses années, le laboratoire ProtMic étudie la bactérie Arthrospira Platensis dans le contexte du projet Melissa de l’Agence spatiale Européenne. L’étude du protéome de cette cyanobactérie montre que la protéine la plus abondante exprimée dans des conditions standarts est une protéine de fonction inconnue. De plus, des analyses phylogéntiques montre que le gène de cette protéine est largement conservé chez les cyanobactéries. Ce projet a pour but l’étude fonctionelle de cette protéine en utilisant différentes approches aussi bien « in Silico » qu’expérimetales. En autre, une étude protéomique à large échelle sera réalisée à l’aide de l’approche SWATH à partir d’échantillons bactériens cultivées dans un grand nombre de conditions différentes (stress salin, de temperature, de nutriment, de lumière,). Parallèlement des études génomiques différentielles et structurales seront initiées. Finalement, l’élaboration et l’étude d’un mutant pour le gène d’intérêt sera également réalisé.